Gastroözofageal reflü varlığı gibi birçok tanı yardımcısı ile net olarak tanısı koyulan barrett özofagusun tedavisi ise ilaç tedavisi ve endoskopik tedavisi ile sağlanabilmektedir. Özofajitin tedavisi dışında barrett özofagusun kendine özgü bir ilaç tedavisi yoktur.