Bu sınıflandırma biçimine göre ökaryot hücrenin temel özelliği genetik malzemelerinin zarla çevrili bir çekirdek içinde yer almasıdır. Prokaryotlarda ise kalıtım maddesi sitoplazma içerisine dağılmıştır. DNA, hücre zarı, sitoplazma sıvısı ve ribozomlar prokaryot ve ökaryot hücrelerin sahip oldukları ortak yapılardır.