Doğu Anadolu Projesi Bölge Kalkınma İdaresi Başkanlığı, 08.06.2011 tarih ve 27958 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 642 numaralı Kanun Hükmünde Kararname ile kurulmuş 17.08.2011 tarih ve 28028 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 649 KHK ile İdare'nin işleyişi ile ilgili esaslar yeniden düzenlenmiştir.